Qui a raison ? médecin conseil ou médecin du travail

Bonjour,
Suite à une maladie professionnelle j'ai subi un intervention à l'épaule qui ne me permet plus d'exercer mon métier d'auxiliaire de vie. Après avoir vu le médecin du travail, ce dernier m'a déclaré apte avec de telles restrictions, qui'il m'est impossible de reprendre mon ancien poste et aucune possibilité de reclassement par mon employeur et pas de possibilié de me licencier car il n'est pas noté "inaptitude"
J'ai été convoqué par le médecin conseil, qui m'a indiqué que je n'étais plus apte à reprendre ce travail avec un aux d'IPP supérieur à 10 %. J'attends sa confirmation par courrier.
Ma question : si le médecin conseil me déclare inapte est ce que cela annule la décision du médecin du travail ?
Cordialement