Probleme d'argent perdu par la banque

En 2006 nous avons contracté un crédit immobilier a la Banque Populaire .Comme nous sommes des auto constructeurs nous débloquions l'argent du prêt avec les factures matériaux au fur et à mesure des travaux réalisés.
Ce janvier 2009 nous avons donné la dernière facture pour clôturer notre crédit,(d'après nous).
La banque elle nous la clôturé avec 2000€ de moins par rapport a nos calculs.
Nous sommes donc allé prouvé avec tous les relevés qu'il manque bien cet argent.
A force on nous a répondu qu'il avait versé cette argent sur un autre compte depuis environs deux ans sans aucune autres formes d'explications .et qu'il allait faire le nécessaire pour régularisé.
Bien évidemment cet argent manquant sur notre compte nous a mis a découvert bancaire dans la mesure ou nous achetions des matériaux avec cet argent.
Et cette banque traîne les pieds pour régulariser la situation ainsi que beaucoup de difficulté pour nous rembourser les agios qui ne sont pas de notre faute.
Quel conseil pouvez vous m'apporter pour faire activer la chose et y a t-il des indemnités nous concernant car quand c'est pour eux comme ces agios que je vous citez plus haut il s'élève a 23% ...